البغدادي في داره الواقعة في طرف المشراق ، وقام مقامه حفيده الحجة السيد أحمد البغدادي وأقام صلاة الجماعة بمكانه في الصحن الحيدري الشريف ، في الجهة الشمالية منه ، واستمر حتى مغادرته النجف الأشرف فرارا من السلطة الظالمة التي أرادت القضاء عليه ، ولا يزال يقوم بواجبه الديني والاجتماعي ، وان حفيد الإمام البغدادي السيد علي الحسني البغدادي هو اليوم من العلماء الأعلام ومن أساتذة الحوزة العلمية في النجف الأشرف .